...

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schemas/
search_templates/
tmpl/
tools/
mt.js
styles.css
mt-upgrade31.cgi

LICENSE-COMMERCIAL
LICENSE-COMMERCIAL-JA
LICENSE-PERSONAL
LICENSE-PERSONAL-JA
mt.cgi
mt-add-notify.cgi
mt-atom.cgi
mt-comments.cgi
mt-db2sql.cgi
mt-search.cgi
mt-send-entry.cgi
mt-set-reg.cgi
mt-tb.cgi
mt-view.cgi
mt-xmlrpc.cgi

赤の plugins、search_templates、mt-comments.cgi は上書きなし。
Movable Typeの脆弱性と対策で公開されたプラグイン
patch-20050124-mail-spam.pl をplugins に設定していたので削除。
mt-comments.cgi はコメントスパム対策で中身を加えているのでそのまま。

新規ファイル、及び上書きファイルは一部修正&小技を加えた後アップロード。
アップロード完了後 cgi のパーミッションの確認、mt-upgrade31.cgi を実行してみる。(3.1xバージョン からアップグレードの場合は必要なし)
成功♪確認後　このファイルは削除。

【修正＆小技】

◇3.01から3.11になった時のサインイン・アウト部分の修正　
　・Movable Type 3.11-ja アップグレード : 小粋空間 さん

◇編集画面のテキストエリア拡張
　tmpl/cms/edit_template.tmlp　128行目あたり　
　赤字部分を　rows="30"　cols="120" に修正。

＜p＞・・・＜textarea name="text" id="text" rows="20" cols="72"＞・・・＜/p＞

◇コメントスパム対策　
　(詳細は書きません。参考サイト: きままにポロポロ さん　from shun. さん)
　extlib/Jcode.pm
　mt-comments.cgi

◇blockquote に改行タグを挿入
　lib/MT/Util.pm　269行目あたり 赤文字を削除

for my $p (@paras) ｛
if ($p !~ m@^＜/?(?:h1|h2|h3|h4|h5|h6|table|ol|dl|ul|
menu|dir|p|pre|center|form|fieldset|blockquote|address|
div|hr)@) ｛
$p =~ s!\r?\n!＜br /＞\n!g;
$p = "＜p＞$＜/p＞";
｝
｝

◇エントリーのハイパーリンクに target_blank を付与。
　mt.js 163行目あたり　target_blank を挿入

function insertLink (e, isMail) ｛
if (!canFormat) return;
var str = getSelection(e);
if (!str) return;
var my_link = isMail ? prompt('Enter email address:') : prompt('Enter URL:', 'http://');
if (isMail) my_link = 'mailto:' + my_link;
if (my_link != null)
setSelection(e, '＜a href="' + my_link + '"target="_blank"＞' + str + '＜/a＞');
return false;
｝

以上だったと思います。^_^;

カテゴリー分け(サブカテゴリーなど)はまた後から考える予定です。
他にも導入したいスクリプトやプラグインがちらついているのですが
それはまた別の機会に。